Некоммерческая организация может расходы по оплате услуг банков на расчетно-кассовое обслуживание учитывать в составе расходов по обычным видам деятельности с отражением их на счете 26 "Общехозяйственные расходы": http://www.garant.ru/consult/business/336918/
Оформление банковских услуг производится через 76 счет. Для коммерческих организаций это: 1) Списание с расчетного счета Дт76 Кт51 2) Поступление товаров и услуг Дт91 Кт76 Для некоммерческих организаций будет: 1) Списание с расчетного счета Дт76 Кт51 2) Поступление товаров и услуг Дт26.02 Кт76 Также для некоммерческих организаций можно отражать без использования счета 76: Списание с расчетного счета Дт26.02 Кт51 При закрытии месяца счет 26.02 автоматически закроется на 86.